function [matrix, matrixInfo]  = blosum90
%BLOSUM90 Clustered Scoring Matrix in 1/2 Bit Units
%   Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat
%   Cluster Percentage: >= 90
%   Entropy =   1.1806, Expected Score =  -0.8887
%   Lowest Score = -6, Highest Score = 11
%
%   Order:
%   A  R  N  D  C  Q  E  G  H  I  L  K  M  F  P  S  T  W  Y  V  B  Z  X  *
%
%   [MATRIX,MATRIXINFO] = BLOSUM90 returns a structure of information about
%   the matrix with fields Name, Scale, Entropy, Expected and Order.

% Source:  ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/matrices/
%   $Revision: 1.5 $ 

matrix = [...
   5 -2 -2 -3 -1 -1 -1  0 -2 -2 -2 -1 -2 -3 -1  1  0 -4 -3 -1 -2 -1 -1 -6 ;...
  -2  6 -1 -3 -5  1 -1 -3  0 -4 -3  2 -2 -4 -3 -1 -2 -4 -3 -3 -2  0 -2 -6 ;...
  -2 -1  7  1 -4  0 -1 -1  0 -4 -4  0 -3 -4 -3  0  0 -5 -3 -4  4 -1 -2 -6 ;...
  -3 -3  1  7 -5 -1  1 -2 -2 -5 -5 -1 -4 -5 -3 -1 -2 -6 -4 -5  4  0 -2 -6 ;...
  -1 -5 -4 -5  9 -4 -6 -4 -5 -2 -2 -4 -2 -3 -4 -2 -2 -4 -4 -2 -4 -5 -3 -6 ;...
  -1  1  0 -1 -4  7  2 -3  1 -4 -3  1  0 -4 -2 -1 -1 -3 -3 -3 -1  4 -1 -6 ;...
  -1 -1 -1  1 -6  2  6 -3 -1 -4 -4  0 -3 -5 -2 -1 -1 -5 -4 -3  0  4 -2 -6 ;...
   0 -3 -1 -2 -4 -3 -3  6 -3 -5 -5 -2 -4 -5 -3 -1 -3 -4 -5 -5 -2 -3 -2 -6 ;...
  -2  0  0 -2 -5  1 -1 -3  8 -4 -4 -1 -3 -2 -3 -2 -2 -3  1 -4 -1  0 -2 -6 ;...
  -2 -4 -4 -5 -2 -4 -4 -5 -4  5  1 -4  1 -1 -4 -3 -1 -4 -2  3 -5 -4 -2 -6 ;...
  -2 -3 -4 -5 -2 -3 -4 -5 -4  1  5 -3  2  0 -4 -3 -2 -3 -2  0 -5 -4 -2 -6 ;...
  -1  2  0 -1 -4  1  0 -2 -1 -4 -3  6 -2 -4 -2 -1 -1 -5 -3 -3 -1  1 -1 -6 ;...
  -2 -2 -3 -4 -2  0 -3 -4 -3  1  2 -2  7 -1 -3 -2 -1 -2 -2  0 -4 -2 -1 -6 ;...
  -3 -4 -4 -5 -3 -4 -5 -5 -2 -1  0 -4 -1  7 -4 -3 -3  0  3 -2 -4 -4 -2 -6 ;...
  -1 -3 -3 -3 -4 -2 -2 -3 -3 -4 -4 -2 -3 -4  8 -2 -2 -5 -4 -3 -3 -2 -2 -6 ;...
   1 -1  0 -1 -2 -1 -1 -1 -2 -3 -3 -1 -2 -3 -2  5  1 -4 -3 -2  0 -1 -1 -6 ;...
   0 -2  0 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -1 -2 -1 -1 -3 -2  1  6 -4 -2 -1 -1 -1 -1 -6 ;...
  -4 -4 -5 -6 -4 -3 -5 -4 -3 -4 -3 -5 -2  0 -5 -4 -4 11  2 -3 -6 -4 -3 -6 ;...
  -3 -3 -3 -4 -4 -3 -4 -5  1 -2 -2 -3 -2  3 -4 -3 -2  2  8 -3 -4 -3 -2 -6 ;...
  -1 -3 -4 -5 -2 -3 -3 -5 -4  3  0 -3  0 -2 -3 -2 -1 -3 -3  5 -4 -3 -2 -6 ;...
  -2 -2  4  4 -4 -1  0 -2 -1 -5 -5 -1 -4 -4 -3  0 -1 -6 -4 -4  4  0 -2 -6 ;...
  -1  0 -1  0 -5  4  4 -3  0 -4 -4  1 -2 -4 -2 -1 -1 -4 -3 -3  0  4 -1 -6 ;...
  -1 -2 -2 -2 -3 -1 -2 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -2 -2 -1 -2 -6 ;...
  -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6 -6  1 ;...
    ];

if nargout >1
    matrixInfo.Name = 'BLOSUM90';
    matrixInfo.Scale = 1/2;
    matrixInfo.Entropy =  1.1806;
    matrixInfo.ExpectedScore =  -0.8887;
    matrixInfo.HighestScore = 11;
    matrixInfo.LowestScore = -6;
    matrixInfo.Order = 'ARNDCQEGHILKMFPSTWYVBZX*';
end
